Zum Kloster Rüde gehörten ein umfangreicher Landbesitz im unmittelbaren Umland sowie einiger Streubesitz. Der Besitz fiel bei der Landesteilung zunächst an Herzog Johann den Älteren und nach dessen Tod an dessen Neffen Johann den Jüngeren , der seine Hauptresidenz von Sonderburg hierher verlegte.
Die Ruinen des Klosters wurden geflutet, und inmitten des so entstandenen Sees wurde ein Wasserschloss errichtet — bis heute eines der berühmtesten in ganz Deutschland. Unter dem Schlosssee liegt noch der alte Friedhof der Mönche. Das Adelsgeschlecht der Glücksburger Holstein-Sonderburg-Glücksburg , welches bis heute die Könige von Dänemark seit und Norwegen seit stellt und von bis auch in Griechenland, ist eine Linie des Hauses Oldenburg.
Diese starb im Jahre aus. Damit löste sich das letzte der abgeteilten Sonderburger Herzogtümer auf. Bis blieb Glücksburg noch Witwensitz der letzten Herzogin, dann wurde es vom dänischen König dem hochadligen Offizier Wilhelm von Sonderburg-Beck übertragen, der einer jüngeren und zu diesem Zeitpunkt nicht mehr regierenden Nebenlinie des in Konkurs geratenen Sonderburger Haupthauses entstammte ebenso wie die Augustenburger. Glücksburg hatte sich inzwischen zu einem Flecken entwickelt, der gewohnheitsrechtlich über einige Handels- und Gewerbefreiheiten verfügte.
Der Flecken Glücksburg erhielt am 1. April das Stadtrecht. Seit der Kaiserzeit existiert in Glücksburg-Sandwig ein florierendes Strandbad.
.svg/800px-CoA_of_Glücksburg_(Ostsee).svg.png "Huren in Glücksburg (Ostsee)")
Seit den er Jahren wird der Stadtteil Bremsberg weiterhin stark ausgebaut. Seit Dezember hat Glücksburg zweisprachige Ortsschilder; unter dem deutschen Glücksburg steht das dänische Lyksborg. Sie befasst sich besonders mit der Geschichte des Schlosses und seiner Bewohner und präsentiert sich der Öffentlichkeit mit Vorträgen und Veranstaltungen im Schloss Glücksburg. Die deutschsprachige evangelisch-lutherische Kirchengemeinde nutzte bis in die er Jahre die Schlosskapelle des Glücksburger Schlosses.
